L’équipe de Sheppard enquête sur l’apparition inexpliquée d’un vaisseau identique au Dédale. Une fois à son bord, un pic d’énergie inexpliqué survient et la cité d’Atlantis n’est plus visible sur les instruments de bords alors que le vaisseau n’a pas bougé… du moins dans le sens conventionnel car il s’est « juste » déplacé dans une dimension parallèle.