Les Réplicateurs ont été anéantis grâce à l’activation de l’arme des Anciens, mais Anubis persévère pour mettre en oeuvre son grand dessein : éradiquer toute vie dans la galaxie. Pendant que les Jaffa, devenus libres, reforment leur armée pour combattre les guerriers d’Anubis repliés sur Tartarus, Daniel amorce pour la seconde fois son processus d’ascension en compagnie d’Oma et Jim, avec qui il se lance dans de longues discussions. Seulement, Anubis a tendu un piège aux Jaffa : Tartarus est déserte et l’arme absolue est tombée entre ses mains. Sur Terre, Sam prépare son mariage avec Pete jusqu’au moment où son père, mourant, lui enjoint de vivre enfin heureuse. Désormais, le sort de la galaxie repose sur Daniel, en pleine discussion avec Jim/Anubis, qui s’est précédemment joué d’Oma pour parvenir à l’illumination et acquérir les pouvoirs considérables dont il jouit actuellement…