L’équipe du Lieutenant Colonel Sheppard est capturée par un groupe dont le chef n’est autre que le Lieutenant Aiden Ford. Ce dernier veut prouver à l’expédition qu’il n’est pas fou et que l’enzyme peut être un atout dans la lutte contre les Wraiths. Il élabore alors un plan avec l’aide de Sheppard et McKay pour détruire un vaisseau ruche qui est en approche, mais tout ne se passe pas comme prévu…