Deux de ses hommes étant menacés de mort pour avoir désobéi aux ordres, le Capitaine Rex doit affronter son commandant extrêmement agressif, le General Krell. Risquant la mutinerie, Rex va devoir faire un choix sombre alors que l’ennemi dévoile son véritable visage. Mais les clones font preuves d’une grande intelligence !